One-semester practical course in English is focused at obtaining an overview and hands-on experience in using computational methods for modern drug design. It is desirable that the attendees have previous knowledge of structure and function of biomolecules, general chemistry and use of computers for scientific work. Aimed at Master students of 1st or 2nd year (potentially 3rd year Bachelor students) and PhD students including medical faculties.
The topics covered in the course:
1. Discovery of new biologically active compounds
2. Structure, dynamics and interactions in biomolecule-ligand complexes
3. Biologically active compounds, their properties and interactions
4. Docking, molecular mechanics and dynamics, scoring
5. Ligand-based drug design
--------------------------------------------------------------------------------
Jednosemestrální praktický kurs (přednášky a cvičení) v angličtině je zaměřen na získání přehledu a praktických dovedností v používání výpočetních metod pro moderní návrh léčiv. Je s výhodou, pokud frekventanti tohoto kursu absolvovali přednášky o struktuře a funkci biomolekul, obecné chemii a použití počítačů k vědecké práci. Určeno pro studenty 1. a 2. ročníku navazujícího magisterského studia (příp. pro 3. ročník bakalářského studia) a pro postgraduální (Ph.D.) studenty včetně lékařských oborů.
V kurzu budou probírána následující témata:
1. Objevování nových biologicky aktivních látek
2. Struktura, dynamika a interakce v komplexech biomolekul s ligandy
3. Biologicky aktivní látky, jejich vlastnosti a interakce
4. Dokování, molekulová mechanika, dynamika, skórování
5. Návrh léků založený na ligandech
- Teacher: Jindřich Fanfrlík
- Teacher: Martin Lepšík