One-semester practical course is focused at obtaining overview and hands-on experience in using computational methods for modern drug design. It is desirable that the attendees have previous knowledge of structure and function of biomolecules, general chemistry and use of computers for scientific work. Aimed at Master students of 1st or 2nd year (potentially 3rd year Bachelor students) and PhD students including medical faculties.
The main topics of the course:
- Discovery of new biologically active compounds
- Pharmacology targets and structure of biomolecule-ligand complexes
- Pharmacological and physicochemical characteristics of compounds
- Docking, molecular mechanics and dynamics, scoring
- Rational drug design in academia and industry.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Jednosemestrální přednáškový kurs je zaměřen na získání přehledu a praktických dovedností v používání výpočetních metod pro moderní návrh léčiv. Je s výhodou, pokud frekventanti tohoto kursu absolvovali přednášky o struktuře a funkci biomolekul, obecné chemii a použití počítačů k vědecké práci. Určeno pro studenty (3.), 4. a 5. ročníku a pro postgraduální (Ph.D.) studenty včetně lékařských oborů.
V kurzu budou probírána následující témata:*
- Objevování nových biologicky aktivních látek
- Farmakologické cíle a struktura komplexů biomolekul s ligandy
- Farmakologické a fyzikálně chemické vlastnosti látek
- Dokování, molekulová mechanika, dynamika, skórování
- Racionální návrh léků v akademickém a průmyslovém prostředí
- Teacher: Karel Berka
- Teacher: Jindřich Fanfrlík
- Teacher: Martin Lepšík